我院制剂室始建于1983年，2000年发展成为青海省藏药制药厂，后经改制，成立了青海金诃藏药药业股份有限公司，但由于体制不同，生产的制剂品种量太少，准字号药品价格高不能满足医院临床需求。为此，我院于2001年重新组建成立了新的医院制剂科，2002年投资对生产车间进行了净化工程改造。为进一步提升我院藏药制剂生产能力，扩大制剂生产规模，加强制剂生产能力建设，切实满足广大患者多样化用药需求，2013年我院向国家申请国家支持藏区建设项目资金，严格按照《医疗机构制剂配制质量管理规范》（GPP）标准新建了藏药制剂中心。

我院藏药制剂中心共设前处理车间、制剂生产、药品质量部、仓贮区及办公区五部分，总建筑面积达12000㎡。设有12种藏药剂型（散剂、丸剂、硬胶囊剂、酒剂、颗粒剂、软膏剂、栓剂、合剂、洗剂、巴布膏剂、煎膏剂、茶剂）生产线，并建立与《药品管理法》、《医疗机构制剂配制质量管理规范》相适应的管理体系，共有生产管理、质量管理类等文件2400余份。并于2017年4月通过省食品药品监督管理局GPP认证，取得医疗机构制剂许可证，现有制剂批准文号368种，253种列入医保乙类支付范围，目前是我省最大的制剂生产基地，年生产藏药量达60吨以上，省内外调剂单位8家。2019年6月24日，青海省藏医院藏药制剂中心确定青海省第一家医疗机构制剂GPP实训基地，为今后更好地做好我省药品GPP现场检查工作,尤其是民族药制剂检查工作奠定了坚实的基础。